Jakub Hruška působí jako přírodovědec v České geologické službě a v Ústavu výzkumu globální změny Akademie věd ČR. Zabývá se různými aspekty ekologie lesů a zemědělské krajiny v souvislostech se znečištěním ovzduší a klimatickou změnou. Je také majitelem lesa na Českomoravské vysočině. Od 90. let se podílel na zpracování řady vládních dokumentů týkajících se změn lesního hospodářství. Působí rovněž jako člen Rad tří národních parků – Šumava, Krkonoše a Podyjí.